MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014002	T	6	6	54897	54902	0 %	100 %	0 %	0 %	294494740
1002	NC_014002	GGCC	2	8	54944	54951	0 %	0 %	50 %	50 %	294494740
1003	NC_014002	TGG	2	6	55036	55041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494740
1004	NC_014002	A	6	6	55092	55097	100 %	0 %	0 %	0 %	294494740
1005	NC_014002	GA	3	6	55123	55128	50 %	0 %	50 %	0 %	294494740
1006	NC_014002	TTG	2	6	55135	55140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494740
1007	NC_014002	GGTCTG	2	12	55296	55307	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294494740
1008	NC_014002	TGA	2	6	55441	55446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494740
1009	NC_014002	GCC	2	6	55547	55552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494740
1010	NC_014002	GCA	2	6	55764	55769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494740
1011	NC_014002	TACCAC	2	12	55778	55789	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294494740
1012	NC_014002	AGG	2	6	55826	55831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494740
1013	NC_014002	CTT	2	6	55863	55868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494740
1014	NC_014002	TTC	2	6	55884	55889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494740
1015	NC_014002	GAT	2	6	55955	55960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494740
1016	NC_014002	AGAT	2	8	55975	55982	50 %	25 %	25 %	0 %	294494740
1017	NC_014002	ATGA	2	8	55983	55990	50 %	25 %	25 %	0 %	294494740
1018	NC_014002	TGA	2	6	56029	56034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494740
1019	NC_014002	TG	3	6	56062	56067	0 %	50 %	50 %	0 %	294494740
1020	NC_014002	AGT	2	6	56112	56117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494740
1021	NC_014002	T	6	6	56163	56168	0 %	100 %	0 %	0 %	294494740
1022	NC_014002	GTCA	2	8	56224	56231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_014002	TAC	2	6	56238	56243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_014002	ATT	2	6	56246	56251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014002	GTATA	2	10	56257	56266	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014002	AAT	2	6	56295	56300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014002	GAAG	2	8	56305	56312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014002	TGC	2	6	56403	56408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494741
1029	NC_014002	GAGAAG	2	12	56551	56562	50 %	0 %	50 %	0 %	294494741
1030	NC_014002	CAT	2	6	56715	56720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494741
1031	NC_014002	TGC	2	6	56823	56828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494741
1032	NC_014002	ATT	2	6	56914	56919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494741
1033	NC_014002	GA	3	6	56947	56952	50 %	0 %	50 %	0 %	294494741
1034	NC_014002	TGGA	2	8	57034	57041	25 %	25 %	50 %	0 %	294494741
1035	NC_014002	GTT	2	6	57121	57126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494741
1036	NC_014002	GAT	2	6	57166	57171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494741
1037	NC_014002	TCA	2	6	57176	57181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494741
1038	NC_014002	CCTATA	2	12	57293	57304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494741
1039	NC_014002	TAT	2	6	57366	57371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494741
1040	NC_014002	AGGC	2	8	57518	57525	25 %	0 %	50 %	25 %	294494741
1041	NC_014002	CTGC	2	8	57580	57587	0 %	25 %	25 %	50 %	294494741
1042	NC_014002	TG	3	6	57617	57622	0 %	50 %	50 %	0 %	294494742
1043	NC_014002	GCC	2	6	57751	57756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494742
1044	NC_014002	CA	3	6	57834	57839	50 %	0 %	0 %	50 %	294494742
1045	NC_014002	ATG	2	6	57851	57856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494742
1046	NC_014002	AAT	2	6	58096	58101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494742
1047	NC_014002	AGGA	2	8	58123	58130	50 %	0 %	50 %	0 %	294494742
1048	NC_014002	GAAT	2	8	58158	58165	50 %	25 %	25 %	0 %	294494742
1049	NC_014002	GGC	2	6	58329	58334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494742
1050	NC_014002	AGA	2	6	58397	58402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494742
1051	NC_014002	AACTG	2	10	58446	58455	40 %	20 %	20 %	20 %	294494742
1052	NC_014002	AAT	2	6	58497	58502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494742
1053	NC_014002	CTG	2	6	58546	58551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494742
1054	NC_014002	GCC	2	6	58585	58590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494742
1055	NC_014002	GATG	2	8	58617	58624	25 %	25 %	50 %	0 %	294494742
1056	NC_014002	TGT	2	6	58731	58736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494742
1057	NC_014002	GAGG	2	8	58752	58759	25 %	0 %	75 %	0 %	294494742
1058	NC_014002	CT	3	6	58838	58843	0 %	50 %	0 %	50 %	294494742
1059	NC_014002	TCT	2	6	58845	58850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494742
1060	NC_014002	CCTG	2	8	58884	58891	0 %	25 %	25 %	50 %	294494742
1061	NC_014002	TCA	2	6	58907	58912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494742
1062	NC_014002	GCA	2	6	58981	58986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494742
1063	NC_014002	TAT	2	6	59008	59013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494742
1064	NC_014002	CGG	2	6	59039	59044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494742
1065	NC_014002	TGC	2	6	59100	59105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494742
1066	NC_014002	A	6	6	59172	59177	100 %	0 %	0 %	0 %	294494742
1067	NC_014002	AGG	2	6	59210	59215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494742
1068	NC_014002	CCA	2	6	59306	59311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494742
1069	NC_014002	CCTGT	2	10	59326	59335	0 %	40 %	20 %	40 %	294494742
1070	NC_014002	GCT	2	6	59352	59357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494742
1071	NC_014002	TAT	2	6	59362	59367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494742
1072	NC_014002	GATA	2	8	59391	59398	50 %	25 %	25 %	0 %	294494742
1073	NC_014002	ATC	2	6	59464	59469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494743
1074	NC_014002	G	6	6	59647	59652	0 %	0 %	100 %	0 %	294494743
1075	NC_014002	GCA	2	6	59785	59790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494743
1076	NC_014002	ATT	2	6	59810	59815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494743
1077	NC_014002	A	7	7	60069	60075	100 %	0 %	0 %	0 %	294494743
1078	NC_014002	ATG	2	6	60132	60137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494743
1079	NC_014002	CGGAT	2	10	60144	60153	20 %	20 %	40 %	20 %	294494743
1080	NC_014002	TTGC	2	8	60197	60204	0 %	50 %	25 %	25 %	294494743
1081	NC_014002	GCA	2	6	60217	60222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494743
1082	NC_014002	GCAGA	2	10	60326	60335	40 %	0 %	40 %	20 %	294494743
1083	NC_014002	GCA	2	6	60422	60427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494743
1084	NC_014002	GTT	2	6	60473	60478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494743
1085	NC_014002	ACC	2	6	60494	60499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494743
1086	NC_014002	AGGA	2	8	60530	60537	50 %	0 %	50 %	0 %	294494743
1087	NC_014002	ATG	2	6	60572	60577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494743
1088	NC_014002	TAC	2	6	60586	60591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494743
1089	NC_014002	ACCGA	2	10	60650	60659	40 %	0 %	20 %	40 %	294494743
1090	NC_014002	CTG	2	6	60672	60677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494743
1091	NC_014002	GGA	2	6	60685	60690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494743
1092	NC_014002	ACAG	2	8	60793	60800	50 %	0 %	25 %	25 %	294494744
1093	NC_014002	TGC	2	6	60815	60820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494744
1094	NC_014002	CAA	2	6	60828	60833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494744
1095	NC_014002	CAT	2	6	60849	60854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494744
1096	NC_014002	AGAA	2	8	60977	60984	75 %	0 %	25 %	0 %	294494744
1097	NC_014002	GGA	2	6	61104	61109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494744
1098	NC_014002	GAAG	2	8	61125	61132	50 %	0 %	50 %	0 %	294494744
1099	NC_014002	ATCT	2	8	61237	61244	25 %	50 %	0 %	25 %	294494744
1100	NC_014002	CAAT	2	8	61252	61259	50 %	25 %	0 %	25 %	294494744
1101	NC_014002	CAA	2	6	61416	61421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494744
1102	NC_014002	GGAA	2	8	61440	61447	50 %	0 %	50 %	0 %	294494744
1103	NC_014002	ATA	2	6	61534	61539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494744
1104	NC_014002	ACG	2	6	61760	61765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494744
1105	NC_014002	AT	3	6	62016	62021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014002	AT	3	6	62025	62030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014002	TCC	2	6	62096	62101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_014002	ATC	2	6	62102	62107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014002	CAT	2	6	62113	62118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014002	CAT	2	6	62122	62127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014002	ACC	2	6	62144	62149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_014002	TGA	2	6	62163	62168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014002	TCTT	2	8	62185	62192	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_014002	CAG	2	6	62227	62232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494745
1115	NC_014002	GTG	2	6	62387	62392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494745
1116	NC_014002	AT	3	6	62449	62454	50 %	50 %	0 %	0 %	294494745
1117	NC_014002	A	6	6	62459	62464	100 %	0 %	0 %	0 %	294494745
1118	NC_014002	GCAT	2	8	62474	62481	25 %	25 %	25 %	25 %	294494745
1119	NC_014002	TTC	2	6	62496	62501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494745
1120	NC_014002	TG	3	6	62533	62538	0 %	50 %	50 %	0 %	294494745
1121	NC_014002	TCA	2	6	62571	62576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494745
1122	NC_014002	AGC	2	6	62579	62584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494745
1123	NC_014002	TAC	2	6	62590	62595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494745
1124	NC_014002	GGT	2	6	62689	62694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494745
1125	NC_014002	ACA	2	6	62723	62728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494745
1126	NC_014002	TTC	2	6	62839	62844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494745
1127	NC_014002	AAG	2	6	62927	62932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494745
1128	NC_014002	GGT	2	6	62944	62949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494745
1129	NC_014002	TTA	2	6	62951	62956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494745
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1133	NC_014002	AAAC	2	8	63090	63097	75 %	0 %	0 %	25 %	294494745
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1146	NC_014002	TGG	2	6	63729	63734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_014002	T	7	7	69187	69193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_014002	ACA	2	6	69199	69204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1256	NC_014002	AGG	2	6	69391	69396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494754
1257	NC_014002	AAT	2	6	69470	69475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_014002	GGAA	2	8	69562	69569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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